Schijfdefragmentatie is een proces waarbij gefragmenteerde bestanden op de vaste schijf van de computer weer tot een geheel worden verenigd. Als u bestanden opslaat, wijzigt of verwijdert, vindt er na verloop van tijd fragmentatie plaats op de vaste schijf. De wijzigingen die u in een bestand opslaat, worden vaak op een andere locatie opgeslagen dan het oorspronkelijke bestand. Extra wijzigingen worden op nog weer andere locaties opgeslagen. Na verloop van tijd raken zowel het bestand als de schijf zelf gefragmenteerd en gaat de computer langzamer werken omdat bijvoorbeeld voor het openen van een bestand op meerdere locaties naar fragmenten van dat bestand moet worden gezocht. Schijfdefragmentatie is een hulpprogramma waarmee de gegevens op de vaste schijf opnieuw worden geordend en waarmee gefragmenteerde bestanden weer tot een geheel worden verenigd, zodat de computer efficiënter kan werken. Bij Windows wordt Schijfdefragmentatie volgens een schema uitgevoerd, zodat u niet zelf in de gaten hoeft te houden wanneer de schijf moet worden gedefragmenteerd. U kunt Schijfdefragmentatie echter desgewenst ook handmatig uitvoeren of het schema voor het automatisch uitvoeren aanpassen.
Door fragmentatie moet de harde schijf met de tijd meer werk verrichten wat ten koste gaat van de snelheid van je PC. Met het programma Schijfdefragmentatie binnen Windows Vista worden gefragmenteerde gegevens opnieuw geordend op de schijf zodat deze sneller en efficiënter kan werken. Standaard staat Schijfdefragmentatie binnen Windows Vista aan en wordt uitgevoerd om de week aan de hand van een vast schema. Om Schijfdefragmentatie te starten ga naar Start en klik op Alle programma's. Kies in het menu voor Bureau-accessoires en klik op Systeemwerkset om vervolgens te kiezen voor Schijfdefragmentatie. Hier is dan vervolgens de Schijfdefragmentatie handmatig te starten of het schema aan te passen door op de knop "Schema aanpassen" te klikken. Door het vinkje weg te halen voor "Gepland uitvoeren" zorg je ervoor dat het niet meer automatisch gestart wordt. Opties voor het schema zijn dagelijks, wekelijks en maandelijks op een eigen ingestelde tijd. Als de PC niet aanstaat op de geplande tijd zal de Schijfdefragmentatie later als de PC wel aanstaat alsnog worden uitgevoerd. Schijfdefragmentatie kan enkele minuten tot enkele uren duren afhankelijk van de fragmentatie op de schijf en de grootte van de schijf.